El Museo de Zaragoza, además de las habituales tareas documentales,  desarrolla diversas líneas de investigación en el área de sus competencias,  relacionadas con los contenidos de sus secciones y la especialidad del personal técnico adscrito a las mismas. Se reseñan las líneas más significativas:

Museología y museografía, Prehistoria y Protohistoria, Romanización, Antigüedad tardía y Alta Edad Media en Aragón y España, Goya, Heráldica, Antropología y Etnología, Numismática, Reinos cristianos hispánicos (hasta s. XV), Conservación-restauración, Arqueometría, Esqueuomorfismo

Gran parte de la bibliografía referente a libros y artículos de los investigadores del Museo, se puede consultar, por autores,  en:

Biblioteca Nacional de España

Deutsches Archäologisches Institut

Dialnet